Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD3P0DMS9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD3P0DMS9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms