Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA8P0DM63 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPA8P0DM63 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms