Protein–RNA interactions for Protein: P0CG01

GKN3P, Gastrokine-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN3PP0CG01 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN3PP0CG01 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GKN3PP0CG01 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms