Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGFB1P01137 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TGFB1P01137 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TGFB1P01137 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms