Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASS1P00966 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASS1P00966 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASS1P00966 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASS1P00966 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASS1P00966 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ASS1P00966 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ASS1P00966 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASS1P00966 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASS1P00966 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASS1P00966 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASS1P00966 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASS1P00966 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASS1P00966 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASS1P00966 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASS1P00966 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASS1P00966 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASS1P00966 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASS1P00966 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ASS1P00966 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ASS1P00966 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ASS1P00966 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASS1P00966 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASS1P00966 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ASS1P00966 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASS1P00966 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASS1P00966 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASS1P00966 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASS1P00966 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASS1P00966 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASS1P00966 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASS1P00966 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASS1P00966 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASS1P00966 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASS1P00966 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASS1P00966 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASS1P00966 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ASS1P00966 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASS1P00966 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASS1P00966 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASS1P00966 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASS1P00966 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASS1P00966 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASS1P00966 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASS1P00966 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASS1P00966 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASS1P00966 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASS1P00966 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASS1P00966 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASS1P00966 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ASS1P00966 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASS1P00966 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASS1P00966 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASS1P00966 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ASS1P00966 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASS1P00966 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASS1P00966 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASS1P00966 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASS1P00966 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASS1P00966 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASS1P00966 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASS1P00966 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASS1P00966 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASS1P00966 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASS1P00966 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASS1P00966 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASS1P00966 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASS1P00966 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASS1P00966 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASS1P00966 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASS1P00966 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASS1P00966 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASS1P00966 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASS1P00966 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASS1P00966 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASS1P00966 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASS1P00966 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASS1P00966 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASS1P00966 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASS1P00966 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASS1P00966 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASS1P00966 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASS1P00966 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASS1P00966 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASS1P00966 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASS1P00966 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASS1P00966 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASS1P00966 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASS1P00966 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASS1P00966 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ASS1P00966 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASS1P00966 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASS1P00966 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASS1P00966 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASS1P00966 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASS1P00966 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASS1P00966 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASS1P00966 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASS1P00966 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASS1P00966 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms