Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSPAN13O95857 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN13O95857 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms