Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAMBPO95630 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPO95630 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291.2 ms