Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX6O95475 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX6O95475 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX6O95475 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX6O95475 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX6O95475 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX6O95475 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX6O95475 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX6O95475 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX6O95475 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX6O95475 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX6O95475 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX6O95475 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX6O95475 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX6O95475 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX6O95475 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX6O95475 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SIX6O95475 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX6O95475 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX6O95475 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX6O95475 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX6O95475 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX6O95475 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX6O95475 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX6O95475 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX6O95475 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX6O95475 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX6O95475 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX6O95475 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX6O95475 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX6O95475 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX6O95475 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX6O95475 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX6O95475 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX6O95475 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX6O95475 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX6O95475 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX6O95475 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX6O95475 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX6O95475 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX6O95475 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX6O95475 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX6O95475 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX6O95475 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX6O95475 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX6O95475 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX6O95475 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX6O95475 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX6O95475 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX6O95475 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX6O95475 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX6O95475 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX6O95475 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX6O95475 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIX6O95475 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIX6O95475 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIX6O95475 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIX6O95475 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIX6O95475 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SIX6O95475 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX6O95475 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX6O95475 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX6O95475 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX6O95475 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX6O95475 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX6O95475 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX6O95475 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX6O95475 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX6O95475 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX6O95475 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX6O95475 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX6O95475 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX6O95475 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX6O95475 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX6O95475 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX6O95475 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX6O95475 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX6O95475 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX6O95475 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX6O95475 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX6O95475 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX6O95475 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX6O95475 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX6O95475 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX6O95475 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX6O95475 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX6O95475 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX6O95475 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX6O95475 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIX6O95475 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIX6O95475 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX6O95475 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX6O95475 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX6O95475 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX6O95475 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX6O95475 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX6O95475 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX6O95475 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX6O95475 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX6O95475 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms