Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN7O95471 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN7O95471 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLDN7O95471 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms