Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH8O95206 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH8O95206 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH8O95206 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH8O95206 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH8O95206 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms