Protein–RNA interactions for Protein: O94941

UBOX5, RING finger protein 37, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBOX5O94941 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBOX5O94941 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBOX5O94941 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBOX5O94941 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBOX5O94941 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBOX5O94941 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBOX5O94941 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBOX5O94941 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBOX5O94941 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBOX5O94941 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBOX5O94941 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBOX5O94941 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBOX5O94941 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBOX5O94941 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms