Protein–RNA interactions for Protein: O75841

UPK1B, Uroplakin-1b, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1BO75841 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UPK1BO75841 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK1BO75841 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UPK1BO75841 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UPK1BO75841 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UPK1BO75841 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPK1BO75841 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UPK1BO75841 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPK1BO75841 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms