Protein–RNA interactions for Protein: O75829

CNMD, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMDO75829 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNMDO75829 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNMDO75829 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNMDO75829 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNMDO75829 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNMDO75829 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNMDO75829 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNMDO75829 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNMDO75829 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNMDO75829 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNMDO75829 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNMDO75829 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNMDO75829 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNMDO75829 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNMDO75829 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNMDO75829 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNMDO75829 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNMDO75829 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNMDO75829 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNMDO75829 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNMDO75829 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNMDO75829 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNMDO75829 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNMDO75829 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNMDO75829 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNMDO75829 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNMDO75829 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNMDO75829 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNMDO75829 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNMDO75829 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNMDO75829 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNMDO75829 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CNMDO75829 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNMDO75829 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CNMDO75829 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNMDO75829 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNMDO75829 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNMDO75829 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNMDO75829 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNMDO75829 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNMDO75829 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNMDO75829 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNMDO75829 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNMDO75829 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNMDO75829 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNMDO75829 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNMDO75829 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNMDO75829 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNMDO75829 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNMDO75829 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNMDO75829 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNMDO75829 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNMDO75829 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNMDO75829 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNMDO75829 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNMDO75829 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNMDO75829 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNMDO75829 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNMDO75829 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNMDO75829 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNMDO75829 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNMDO75829 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNMDO75829 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNMDO75829 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNMDO75829 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNMDO75829 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNMDO75829 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNMDO75829 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNMDO75829 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNMDO75829 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNMDO75829 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNMDO75829 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNMDO75829 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CNMDO75829 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNMDO75829 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CNMDO75829 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNMDO75829 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNMDO75829 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNMDO75829 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNMDO75829 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNMDO75829 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNMDO75829 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNMDO75829 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNMDO75829 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNMDO75829 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNMDO75829 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNMDO75829 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CNMDO75829 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNMDO75829 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CNMDO75829 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNMDO75829 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNMDO75829 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNMDO75829 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CNMDO75829 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNMDO75829 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNMDO75829 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNMDO75829 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNMDO75829 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNMDO75829 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNMDO75829 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms