Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA2O43921 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA2O43921 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA2O43921 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA2O43921 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA2O43921 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA2O43921 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA2O43921 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA2O43921 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFNA2O43921 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA2O43921 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms