Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALUO43852 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALUO43852 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALUO43852 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALUO43852 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALUO43852 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALUO43852 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALUO43852 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALUO43852 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALUO43852 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALUO43852 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALUO43852 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALUO43852 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALUO43852 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALUO43852 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALUO43852 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALUO43852 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALUO43852 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CALUO43852 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CALUO43852 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALUO43852 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALUO43852 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALUO43852 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALUO43852 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALUO43852 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALUO43852 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALUO43852 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALUO43852 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALUO43852 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALUO43852 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALUO43852 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALUO43852 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALUO43852 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CALUO43852 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALUO43852 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALUO43852 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALUO43852 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALUO43852 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALUO43852 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CALUO43852 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALUO43852 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALUO43852 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALUO43852 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALUO43852 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALUO43852 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALUO43852 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CALUO43852 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALUO43852 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALUO43852 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALUO43852 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALUO43852 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALUO43852 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALUO43852 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALUO43852 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALUO43852 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALUO43852 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALUO43852 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALUO43852 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CALUO43852 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALUO43852 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALUO43852 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALUO43852 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALUO43852 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALUO43852 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALUO43852 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALUO43852 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALUO43852 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALUO43852 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALUO43852 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALUO43852 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALUO43852 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALUO43852 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALUO43852 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALUO43852 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CALUO43852 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALUO43852 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CALUO43852 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CALUO43852 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALUO43852 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALUO43852 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALUO43852 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALUO43852 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CALUO43852 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALUO43852 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALUO43852 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALUO43852 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALUO43852 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALUO43852 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALUO43852 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALUO43852 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CALUO43852 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALUO43852 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALUO43852 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALUO43852 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALUO43852 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALUO43852 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALUO43852 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALUO43852 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALUO43852 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALUO43852 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms