Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDB2O43679 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDB2O43679 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDB2O43679 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDB2O43679 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LDB2O43679 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDB2O43679 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDB2O43679 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDB2O43679 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LDB2O43679 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDB2O43679 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LDB2O43679 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LDB2O43679 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LDB2O43679 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDB2O43679 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDB2O43679 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDB2O43679 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDB2O43679 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDB2O43679 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDB2O43679 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LDB2O43679 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDB2O43679 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDB2O43679 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDB2O43679 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDB2O43679 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDB2O43679 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDB2O43679 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDB2O43679 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDB2O43679 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDB2O43679 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDB2O43679 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LDB2O43679 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDB2O43679 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDB2O43679 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDB2O43679 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDB2O43679 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDB2O43679 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDB2O43679 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDB2O43679 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDB2O43679 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDB2O43679 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDB2O43679 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDB2O43679 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDB2O43679 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDB2O43679 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LDB2O43679 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDB2O43679 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDB2O43679 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDB2O43679 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDB2O43679 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDB2O43679 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDB2O43679 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDB2O43679 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDB2O43679 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDB2O43679 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDB2O43679 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDB2O43679 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDB2O43679 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LDB2O43679 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDB2O43679 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDB2O43679 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDB2O43679 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDB2O43679 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDB2O43679 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDB2O43679 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDB2O43679 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDB2O43679 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDB2O43679 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDB2O43679 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDB2O43679 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDB2O43679 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDB2O43679 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDB2O43679 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDB2O43679 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDB2O43679 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDB2O43679 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDB2O43679 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDB2O43679 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDB2O43679 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDB2O43679 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDB2O43679 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDB2O43679 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDB2O43679 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LDB2O43679 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDB2O43679 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDB2O43679 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB2O43679 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB2O43679 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB2O43679 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB2O43679 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB2O43679 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB2O43679 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB2O43679 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB2O43679 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB2O43679 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB2O43679 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDB2O43679 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDB2O43679 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LDB2O43679 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB2O43679 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms