Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSI1O43347 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSI1O43347 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSI1O43347 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSI1O43347 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSI1O43347 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSI1O43347 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MSI1O43347 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSI1O43347 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSI1O43347 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSI1O43347 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSI1O43347 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSI1O43347 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MSI1O43347 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSI1O43347 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSI1O43347 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSI1O43347 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSI1O43347 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSI1O43347 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSI1O43347 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSI1O43347 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSI1O43347 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSI1O43347 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MSI1O43347 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSI1O43347 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSI1O43347 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSI1O43347 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSI1O43347 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSI1O43347 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSI1O43347 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSI1O43347 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MSI1O43347 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSI1O43347 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSI1O43347 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSI1O43347 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSI1O43347 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSI1O43347 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
MSI1O43347 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSI1O43347 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSI1O43347 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSI1O43347 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSI1O43347 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MSI1O43347 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSI1O43347 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MSI1O43347 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSI1O43347 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSI1O43347 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MSI1O43347 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSI1O43347 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSI1O43347 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSI1O43347 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSI1O43347 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSI1O43347 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSI1O43347 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSI1O43347 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSI1O43347 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSI1O43347 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MSI1O43347 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSI1O43347 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSI1O43347 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSI1O43347 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSI1O43347 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSI1O43347 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSI1O43347 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSI1O43347 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSI1O43347 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSI1O43347 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSI1O43347 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSI1O43347 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSI1O43347 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSI1O43347 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSI1O43347 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSI1O43347 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MSI1O43347 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSI1O43347 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSI1O43347 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSI1O43347 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSI1O43347 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSI1O43347 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MSI1O43347 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSI1O43347 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MSI1O43347 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MSI1O43347 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSI1O43347 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSI1O43347 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSI1O43347 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSI1O43347 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSI1O43347 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSI1O43347 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSI1O43347 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSI1O43347 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSI1O43347 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSI1O43347 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MSI1O43347 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSI1O43347 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSI1O43347 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSI1O43347 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSI1O43347 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSI1O43347 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSI1O43347 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms