Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DYNC1LI2O43237 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DYNC1LI2O43237 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
DYNC1LI2O43237 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms