Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD3EAPO15446 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD3EAPO15446 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD3EAPO15446 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms