Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
POLR3AO14802 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
POLR3AO14802 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLR3AO14802 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms