Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN5O00501 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN5O00501 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN5O00501 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN5O00501 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN5O00501 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN5O00501 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN5O00501 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN5O00501 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN5O00501 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN5O00501 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN5O00501 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN5O00501 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN5O00501 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLDN5O00501 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN5O00501 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 566.6 ms