Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC7O00311 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC7O00311 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC7O00311 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC7O00311 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC7O00311 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC7O00311 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC7O00311 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC7O00311 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC7O00311 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC7O00311 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC7O00311 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC7O00311 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC7O00311 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC7O00311 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC7O00311 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC7O00311 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC7O00311 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC7O00311 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC7O00311 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC7O00311 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC7O00311 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC7O00311 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC7O00311 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC7O00311 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC7O00311 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC7O00311 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC7O00311 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC7O00311 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC7O00311 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC7O00311 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC7O00311 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC7O00311 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC7O00311 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC7O00311 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC7O00311 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC7O00311 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC7O00311 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC7O00311 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC7O00311 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC7O00311 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC7O00311 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC7O00311 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC7O00311 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC7O00311 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC7O00311 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC7O00311 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC7O00311 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC7O00311 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC7O00311 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC7O00311 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC7O00311 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC7O00311 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC7O00311 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC7O00311 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC7O00311 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC7O00311 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC7O00311 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC7O00311 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CDC7O00311 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC7O00311 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC7O00311 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC7O00311 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC7O00311 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC7O00311 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC7O00311 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC7O00311 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC7O00311 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC7O00311 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC7O00311 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC7O00311 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC7O00311 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC7O00311 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC7O00311 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC7O00311 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC7O00311 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC7O00311 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC7O00311 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC7O00311 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC7O00311 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC7O00311 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC7O00311 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC7O00311 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC7O00311 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC7O00311 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC7O00311 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC7O00311 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC7O00311 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC7O00311 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDC7O00311 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC7O00311 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC7O00311 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC7O00311 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC7O00311 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC7O00311 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC7O00311 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC7O00311 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC7O00311 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC7O00311 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC7O00311 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms