Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
F8VP50 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
F8VP50 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
F8VP50 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
F8VP50 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
F8VP50 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
F8VP50 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
F8VP50 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
F8VP50 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
F8VP50 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
F8VP50 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
F8VP50 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
F8VP50 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
F8VP50 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
F8VP50 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
F8VP50 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
F8VP50 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
F8VP50 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
F8VP50 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
F8VP50 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
F8VP50 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
F8VP50 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
F8VP50 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
F8VP50 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
F8VP50 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
F8VP50 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
F8VP50 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
F8VP50 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
F8VP50 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
F8VP50 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
F8VP50 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
F8VP50 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
F8VP50 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
F8VP50 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
F8VP50 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
F8VP50 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
F8VP50 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
F8VP50 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
F8VP50 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
F8VP50 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
F8VP50 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
F8VP50 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
F8VP50 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
F8VP50 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
F8VP50 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
F8VP50 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F8VP50 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
F8VP50 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
F8VP50 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
F8VP50 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
F8VP50 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F8VP50 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
F8VP50 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
F8VP50 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
F8VP50 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F8VP50 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
F8VP50 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
F8VP50 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
F8VP50 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
F8VP50 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F8VP50 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
F8VP50 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F8VP50 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
F8VP50 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
F8VP50 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
F8VP50 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
F8VP50 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
F8VP50 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
F8VP50 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
F8VP50 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
F8VP50 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
F8VP50 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
F8VP50 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
F8VP50 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
F8VP50 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
F8VP50 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
F8VP50 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
F8VP50 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
F8VP50 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
F8VP50 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
F8VP50 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
F8VP50 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
F8VP50 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
F8VP50 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
F8VP50 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
F8VP50 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
F8VP50 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
F8VP50 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
F8VP50 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
F8VP50 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
F8VP50 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
F8VP50 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
F8VP50 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
F8VP50 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
F8VP50 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
F8VP50 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
F8VP50 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
F8VP50 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
F8VP50 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
F8VP50 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms