Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PROB1E7EW31 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROB1E7EW31 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PROB1E7EW31 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms