Protein–RNA interactions for Protein: A8MV72

Putative UPF0607 protein ENSP00000382826, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MV72 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A8MV72 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MV72 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MV72 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MV72 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MV72 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MV72 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MV72 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MV72 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MV72 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MV72 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MV72 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MV72 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MV72 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MV72 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MV72 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MV72 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MV72 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MV72 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MV72 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MV72 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MV72 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MV72 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MV72 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MV72 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MV72 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MV72 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MV72 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MV72 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MV72 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MV72 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MV72 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MV72 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MV72 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MV72 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MV72 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MV72 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MV72 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MV72 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MV72 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MV72 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MV72 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MV72 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MV72 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MV72 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MV72 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MV72 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MV72 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MV72 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MV72 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MV72 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MV72 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MV72 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MV72 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MV72 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MV72 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MV72 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MV72 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MV72 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MV72 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MV72 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MV72 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MV72 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MV72 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MV72 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MV72 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MV72 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MV72 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MV72 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MV72 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MV72 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MV72 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MV72 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MV72 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MV72 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MV72 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MV72 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MV72 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MV72 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MV72 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A8MV72 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A8MV72 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A8MV72 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A8MV72 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A8MV72 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A8MV72 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A8MV72 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A8MV72 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A8MV72 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A8MV72 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A8MV72 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A8MV72 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A8MV72 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A8MV72 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MV72 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MV72 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MV72 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MV72 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MV72 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MV72 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms