Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC169A6NNP5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC169A6NNP5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms