Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN8A6NHC0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN8A6NHC0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms