Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP73A6NFT4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CFAP73A6NFT4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms