Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRIM43BA6NCK2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM43BA6NCK2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM43BA6NCK2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM43BA6NCK2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms