Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A0U1RQF3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A0U1RQF3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0U1RQF3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms