Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms