Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms