Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms