Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms