Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MTMR3Q13615 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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