Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB4BP68371 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms