Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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KCNQ1P51787 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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KCNQ1P51787 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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KCNQ1P51787 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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KCNQ1P51787 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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