Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD52P43351 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD52P43351 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD52P43351 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD52P43351 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD52P43351 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD52P43351 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD52P43351 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD52P43351 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD52P43351 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD52P43351 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms