Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms