Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms