Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00032P0C843 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms