Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XKR8Q9H6D3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms