Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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NCOA1Q15788 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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NCOA1Q15788 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
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NCOA1Q15788 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
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NCOA1Q15788 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
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NCOA1Q15788 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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NCOA1Q15788 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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NCOA1Q15788 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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NCOA1Q15788 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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NCOA1Q15788 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
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NCOA1Q15788 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
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NCOA1Q15788 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
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