Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms