Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP53Q96M91 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms