Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms