Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SND1Q7KZF4 IGFBP2-203ENST00000436812 751 ntTSL 312.28□□□□□ -0.442e-7■□□□□ 9
SND1Q7KZF4 SGCE-211ENST00000522045 408 ntTSL 39.08□□□□□ -0.962e-7■□□□□ 9
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SND1Q7KZF4 PBXIP1-206ENST00000498553 777 ntTSL 516.9■□□□□ 0.35e-8■□□□□ 9
SND1Q7KZF4 ENO1-203ENST00000486051 536 ntTSL 37.37□□□□□ -1.234e-49■□□□□ 9
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SND1Q7KZF4 TFR2-203ENST00000461176 692 ntTSL 318■□□□□ 0.472e-7■□□□□ 9
SND1Q7KZF4 ITIH3-210ENST00000495622 920 ntTSL 515.4■□□□□ 0.065e-24■□□□□ 9
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SND1Q7KZF4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.075e-8■□□□□ 9
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SND1Q7KZF4 EIF3G-206ENST00000588709 828 ntTSL 514.11□□□□□ -0.155e-8■□□□□ 9
SND1Q7KZF4 QARS-205ENST00000430182 2399 ntTSL 214.11□□□□□ -0.155e-8■□□□□ 9
SND1Q7KZF4 EIF3G-202ENST00000587146 709 ntTSL 513.42□□□□□ -0.265e-8■□□□□ 9
SND1Q7KZF4 EIF3G-209ENST00000589674 596 ntTSL 213.23□□□□□ -0.295e-8■□□□□ 9
SND1Q7KZF4 QARS-202ENST00000414533 2412 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.35e-8■□□□□ 9
SND1Q7KZF4 EIF3G-214ENST00000593066 590 ntTSL 513.05□□□□□ -0.325e-8■□□□□ 9
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SND1Q7KZF4 QARS-211ENST00000470113 954 ntTSL 512.89□□□□□ -0.355e-8■□□□□ 9
SND1Q7KZF4 QARS-248ENST00000636669 2410 ntTSL 512.72□□□□□ -0.375e-8■□□□□ 9
SND1Q7KZF4 QARS-216ENST00000482248 887 ntTSL 512.56□□□□□ -0.45e-8■□□□□ 9
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SND1Q7KZF4 EIF3G-208ENST00000589454 873 ntTSL 511.01□□□□□ -0.655e-8■□□□□ 9
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SND1Q7KZF4 QARS-210ENST00000466179 334 ntTSL 35.43□□□□□ -1.545e-8■□□□□ 9
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SND1Q7KZF4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.434e-23■□□□□ 9
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SND1Q7KZF4 RPL18-203ENST00000547892 3844 nt13.2□□□□□ -0.34e-23■□□□□ 9
SND1Q7KZF4 PKM-208ENST00000563275 699 ntTSL 1 (best)12.89□□□□□ -0.357e-8■□□□□ 9
SND1Q7KZF4 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.074e-12■□□□□ 9
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SND1Q7KZF4 LSR-209ENST00000601623 530 ntTSL 511.29□□□□□ -0.63e-8■□□□□ 9
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SND1Q7KZF4 PKM-206ENST00000562784 529 ntTSL 211.31□□□□□ -0.64e-14■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 PKM-207ENST00000562997 582 ntTSL 410.47□□□□□ -0.734e-14■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 PKM-210ENST00000564178 554 ntTSL 49.78□□□□□ -0.844e-14■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.162e-6■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.182e-6■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.272e-6■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 CPED1-207ENST00000466055 543 ntTSL 36.21□□□□□ -1.422e-6■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.854e-12■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.744e-12■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.594e-12■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.424e-7■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 EIF5A-209ENST00000573714 602 ntTSL 321.52■■□□□ 1.044e-12■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.024e-12■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.674e-7■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.674e-12■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.314e-12■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.244e-12■□□□□ 8.9
SND1Q7KZF4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.134e-7■□□□□ 8.9
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