Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms