Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
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