Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms